Le Cemagref est un organisme public de recherche finalisée sur la gestion des eaux et des territoires. Ses recherches sont orientées vers la production de connaissances nouvelles et d’innovations techniques utilisées par les gestionnaires, les décideurs et les entreprises pour répondre à des questions concrètes de société dans les domaines de la gestion des ressources, de l’aménagement et de l’utilisation de l’espace. Le Cemagref est impliqué dans de nombreux projets ayant trait aux contamination et à la protection des eaux. Il est impliqué dans la recherche nationale et internationale dans des programmes agricoles traitant des pollutions non-pontuelles. Le Cemagref a méne des recherches sur le comportement des pesticides dans l’eau et le sol depuis plus de vingt ans, et se concentre sur les fossés végétalisés, les milieux humides naturels entrecoupés de drainages agricoles de sous-surface. Le Cemagref a déjà pris part dans plusieurs projets européens se concentrant sur les pollutions agricoles et leur effet sur la qualité de l’eau, dans des actions COST et dans le groupe de travail FOCUS.